Faggruppe for kjemometri

Programmet
Faglige sammendrag
Tekniske detaljer

Ett av de sikre vårtegnene langs Bergensbanen er kjemometrikere på tur. I år gikk det for første gang ut over stasjonsbyen Ål. Væpnet med et faglig program som ikke stod tilbake for noen internasjonale kongresser samlet styret i faggruppen seg kvelden i forveien til siste finpuss og forberedelser. Dvs, restene av styret samlet seg. Lederen var indisponert grunnet uvettige fysiske utskeielser av en mann på hans alder, nestleder var permittert grunnet mini-kjemometrikerproduskjon og et av styremedlemmene var utkommandert til annen virksomhet i nasjonens interesse. Grunnet god planlegging og med kjemometrikeres pragmatiske holdning bød ikke dette på problemer. (Les: Faggruppens sekretær gjennom 4 år - Bjørg Narum Nilsen, alias Mor-kjemometri, hadde nok en gang latt være å glemme mer enn vi andre noensinne kommer til å huske)
Derfor gjorde vi stort sett som hun sa, og tok i mot de første deltagerne, og åpnet symposiet, osb.
Ett invitert foredrag av Eivind Hovig, koordinator for FUGE bioinformatikk i Osloregionen åpnet ballet. Han gav oss brystkreftgenet på kromosom 17 og viste oss hvordan spredning av særnorske mutasjoner hadde tatt Trondheimsleden via Østerdalen og hvordan vestlendinger som liker båt hadde landsatt slike i Troms. Alt før den store pesten fra 1349. Mikromatriseteknologien gir mye støy og er lite replikerbar, og det drives derfor særs få sammenlignende studier, og det blir publisert på råtne data. Bioinformatikk blir nok en vekstnæring innen kjemometrimiljøet, og er allerede fanget opp av NCG, kjemometrigruppen ved NTNU. Nestemann på programmet lå hjemme å ventet på enda en mini-kjemometriker som hadde spent hodet fast i ferdigstilling, og derfor tjuvstartet NTNU-gruppen sin presentasjon. Man fikk en skrekkhistorie om hva som skjer dersom man stoler blindt på metodene. Fra en tabell av tilfeldige tall som avstedkom spørsmålet " Kor è lasjonen?" ble det ved en sammenklasket matlabkode tryllet frem en korrelasjon på 0.93!
Neste sesjon ble åpnet av nok et invitert foredrag. I kortversjon fortalte innkjøpssjef Knut Iversen om en 6-trinnsprosess i markedsundersøkelse og viktigheten av å snakke skikkelig og tydelig sammen for å enes om strategier. Hans siste poeng er noe som dessverre blir mer og mer nødvendig og vanlig; ordentlige skilsmisseklausuler.
Resten av kvelden gikk med til en fin serie pedagogiske innlegg om kjemometriske metoder, samt to politiske markeringer. Ulf Indahl fra landbrukshøgskolen steppet inn i siste liten med innlegget " Er det mer å hente fra ideene bak tradisjonell PLS-regresjon" og presenterte etter eget sigende ¾ fordøyde kriterier om erstatning av cov(x,y) med corr(x,y) og sin egen definisjon av tallet null, type 10^-12 lik null. Rolf Ergon og Harald Martens tok antall ligninger p.r lysark til nye høyder og sistnevnte viste frem kveldens antageligvis hyppigst kopierte lysark.
Kveldens mest lavmælte politiske markering var bruk av svart sørgebakgrunn på lysarkene etter at en av foredragsholderne for kort tid siden fant at en blåruss med nytt viskelær hadde utradert arbeidsplassen hans og avdelingen med 5 ansatte. Den minst lavmælte politiske markeringen så ut til å bli kvalt allerede i fødselen da fingertrøbbel med lavteknologi gav flimrende skjermer og ekstra kaffepauser. Etter forbannelser og tenners gnissel ordnet et avbalansert styremedlem opp i teknologirotet og Bjørn Alsberg fortalte forsamlingen av Matlab-avhengige hva misbruk/abstinens kan føre med seg. Bl.a. rigide lisenser, høy pris, lav fleksibilitet, prisgitt Mathworks evne og vilje til å viderutvikle programmet og at kildekoden ikke er åpen. Kuren var en kloning. Ikke sangen Kloning av gruppen Kjøtt som ble utgitt tidlig på 80-tallet, men programkloningen Octave. Dette er en Matlabkloning utviklet av John W. Eaton i 1988, og er en uferdig, gratis, åpen-kildet erstattning for Matlab. Alsberg inviterte kjemometrimiljøene til dugnad for å utvikle modulene som enda mangler, og talte ikke for døve ører. Under plenumssesjonen senere på kvelden, medførte disse ideene lanseringen av uttrykket softwaresosialisme.
Morgensesjonen tirsdag åpnet med to softwaresosialistiske innlegg. Det første var intra-sosialistisk med ekstrem åpen tilgang til alle bedriftens data og modeller, visualisert med asynkrone stereobilder, det neste fulgte prinsippene; 1) åpen kildekode, 2) gi det akademiske miljø et verktøy som gjør det rakst og enkelt å implementere nye kjemometriske metoder. Slike gutter, det vil gamle Norge ha. Den som kjenner sin besøkelsestid besøker www.zherlock.org snarest råd. Men vær advart; prosjektet er enda heftet med noe clunky software!
Da var podiet ryddet og klart for Alsbergs NCG-Arme fra NTNU. Bjørn Alsberg har overtatt det Nordenfjeldske kjemometriprofessoratet etter kjemometribautaene Odd Borgen og Harald Martens. På sin korte virketid har Alsberg fått til en imponerende og omfattende aktivitet støttet av en stor gruppe unge, entusiastiske og dyktige, om enn noe urutinerte, 5.-års studenter og stipendiater. De pøste på med validering, variabelseleksjon, bioinformatikk og signaltilpassing. Om råtne mikromatrisedata er sitatet "æ vart heilt sjokkert - så myttji støy" blant de minneverdige sammen med en makelaus robotarmsimulering. At det i Barteby vil bli et nytt kjemometrisk kraftsentrum synes klart. Sesjonen ble desverre skjemmet av noe teknisk trøbbel som tøyde forsamlingens tolmodighet.
"Et rent helvete" var den hjemvendte organisk-kjemometriker Bjørsviks oppsummering av forholdene i autoklavene for vanilinproduksjon basert på lignosulfonat. Dette forstod selv faggruppens store gruppe medlemmer som er (kjemisk?) fri for kjemisk bakgrunn. I dette inviterte foredraget viste han hvordan enkle og pragmatiske anvendelser av kjemometriske metoder gagner organisk syntetisk kjemi så det monner. Fra kjemometrimiljøet etterlyste han innsats i å bringe faktormodellene våre over på t.d. kinetiske Arrheniusmodeller, og en innsats for Grønn kjemi! Helvetesprosessesjonen ble avsluttet med en forklaring på utfordringen det er å utvikle on-line modeller i PEL-produksjon ved 1200 bars trykk.
Etter dette var det tid for snøbaserte fellesaktiviteter. Det var da vi skjønte hvorfor et av styremedlemmene meldte avbud til symposiet. Et 1500m langt "Sturzlauf" på 15 kilos kjelker ventet. Det måtte gå galt med så mange kjemometrikere på livsfarlig redskap. Til skogs i alle rettninger synes å være mottoet. Noen grov seg ned også. At melk kanskje er like sunt som øl er TINEs svar på Matti Hautameki et levende bevis på. Med en rennefart langt over all rimelighets grenser tok han av fra hoppet som Ål-Orbiter og landet på sletten, ublidt men uskadet. Dette overgikk fotografens evne til å predikere flygebanen, men han klarte å fange kjeklehoppingens Eddie the Eagle i linsen. Noen av sårene ble leget ved kontrollert bruk av raffinerte rotfrukter, men ingen hadde husket å ta med tørre underbukser.
Kveldens generalforsamling ble avholdt innen den oppsatte tidsrammen og det var tid for bankett. Om den skal det ikke sies mye, men at lederen nok kommer til å stille neste år uansett helsetilstand kan denne diktduellen via telenettets kortmeldingssystem vitne om. Her er det forsøkt å gjengi poesien i kronologisk rekkefølge.

Onsdag åpnet så langt fra softwaresosialisme og åpen kildekode som mulig, nemlig med softwarekaptialisme i form av Unscrambler, versjon 8.0. Deretter var det to sesjoner som igjen viser spennet i anvendelser av kjemometriske metoder, også i Bergenske fiskeskrøner. Vi fikk se PCA anvendt i neuronal ceroid lipofuscinosestudier, optisk pH bestemmelse i fisk og fiskefilm (800kb) med sterke scener og tegnestifter(5MB) . Gjett hvem som fortalte om kveitene Reidun, Ronja og den tykkfalne Anne-Katrines individuelle dietter? Svaret! Til slutt ble det vist hvordan ulike forsøksdesigner kan føre frem i produksjon av radiofarmaka og godt torskefór basert på næringsverdi og økonomi.
Etter tre dager med kjøtt til middag dro vi hjem for å spise fersk fisk, for ingen gjør vel tabben med å spise marin fisk til fjells?

Kjemometrisk helsing Egil

Foto: Geir Christian Karlsen, Thomas Eriksen og Ørjan Breivik

Alle fotografiene med fotograf Eriksens kommentarer finner du her