Introduction to R.
Teacher: Solve Sæbø, IKBM, UMB (på engelsk eller
norsk, alt etter behov)
This is a half day (four lessons) course where
the participants will get familiar with simple use of the statistics
software R. The course is aimed at users who are not familiar
with R. Each participant should bring a laptop with R installed.
The R software can be downloaded from the R-Project site.
Go to http://cran.r-project.org/
At the top you can choose between installation files for Linux,
Mac or Windows. Select the version of your choice and select
the Base-installation. This will give you the basic version
of R. We will later see how add-on packages can be installed.
All participants should install R before the first lesson.
Take contact (solve.sabo@umb.no)
in case of installation questions.
Temporary list of topics:
-Introduction
-The user interface, finding help, etc.
-Simple data handling
-Objects and classes Matrices, arrays, dataframes Notation Reading/writing/saving/scripts
-Linear models in R, ANOVA, PLS, PCR -Graphics in R -Creating
own functions, loops etc.
Metoder og eksempler på data-analyse av
metabolske og proteomiske profiler
Olav M. Kvalheim, Kjemisk institutt, Universitetet
i Bergen.
Sammendrag
Kurset gir en oversikt over metoder for å analysere profiler
fra massespektrometri (SELDI og MALDI) og proton NMR.
Metoder for forbehandling av data, multivariat analyse av data
og tolkning av data vil bli gjennomgått.
Metodikk for valg av biomarkører fra komplekse spektrale profiler
vil også bli gjennomgått.
Praktiske eksempler av analyser av spinalvæske og blodserum
vil bli brukt for å anskueliggjøre metoder og strategi.
